SUIVI DE L’AXE INTESTIN-POUMON DES PATIENTS ATTEINTS DE MUCOVISCIDOSE ET TRAITES PAR LA COMBINAISON ELEXACAFTOR/TEZACAFTOR/IVACAFTOR : ETUDE DU MICROBIOTE ET DE L’INFLAMMATION PULMONAIRES ET DIGESTIVES

La mucoviscidose est une maladie systémique, qui affecte notamment les
systèmes respiratoire et digestif des patients, sièges d’une inflammation
chronique. Il a par ailleurs été montré que chez ces patients, les microbiotes
pulmonaire et intestinal étaient distincts de ceux des sujets sains et que
l'évolution de la maladie était associée à des altérations de ces microbiotes
(Madan et al., 2012; Stokell et al., 2015). De plus, de nombreuses données
suggèrent l’existence d’un « axe intestin-poumon » et incitent donc à étudier en
parallèle ces deux organes et non de manière séparée (Enaud et al., 2020).
La prise en charge de la mucoviscidose a été marquée ces dernières années par
l’apparition de modulateurs du CFTR, notamment la combinaison
lumacaftor/ivacaftor (LUM/IVA) (pour les patients homozygotes F508del). Les
critères d’évaluation de l’efficacité de ces traitements reposent sur l’évolution
de VEMS (Volume expiratoire maximal en 1 seconde), le nombre
d’exacerbations, l’indice de masse corporelle ou la qualité de vie. Cependant, il
est essentiel de pouvoir documenter l’effet de ces traitements sur le microbiote
et l’inflammation pulmonaires et digestifs. Depuis 2016, nous avons mis en
place la cohorte nationale « Lum-Iva-Biota » et avons pu montrer que l’effet de
LUM/IVA sur le microbiote pulmonaire était plus marqué chez les patients non
colonisés préalablement à P. aeruginosa (article en cours).
Une nouvelle combinaison associant elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor a prouvé
son efficacité pour le traitement des patients de 12 ans et plus porteurs de deux
mutations F508del ou d’une mutation dite « à fonction minimale » associée à
une mutation F508del (Middleton et al., 2019). Etant donné que ce traitement cible de nouvelles mutations et que l’efficacité semble plus importante qu’avec LUM/IVA, il est
important d’évaluer son impact sur le microbiote et l’inflammation pulmonaires
et digestifs des patients.
Il s’agit donc de mettre à profit l’expérience de la cohorte Lum-Iva-Biota, et le
circuit validé et opérationnel des échantillons établi dans les différents centres participants pour mettre en place une collection biologique pour le recueil et le
stockage des expectorations et des selles des patients durant la première année
de traitement par elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor, afin d’étudier l’effet du
traitement sur le microbiote/mycobiote et l’inflammation pulmonaires et
digestifs.