Identification de marqueurs épigénétiques prédictifs de la sévérité de l’atteinte pulmonaire dans la mucoviscidose

La mucoviscidose est causée par des mutations du gène CFTR. Chez les patients qui en sont atteints, l’atteinte pulmonaire est le principal facteur de risque et la plus importante cause de mortalité.

Deux types de facteurs sont évoqués pour expliquer la variabilité de l'expression de cette pathologie : des facteurs génétiques et des facteurs environnementaux. Les facteurs génétiques ont été largement explorés : plusieurs gènes modificateurs de la pathologie ont été identifiés. En revanche, les facteurs environnementaux restent méconnus.

Il a été établi que des facteurs environnementaux régulent et modifient l’expression du gène et entrainent des modifications dites épigénétiques. Nous nous intéressons à une modification épigénétique particulièrement bien connue et facile à mesurer (la méthylation de l’ADN).

Lors d’une précédente étude réalisée sur 50 patients, nous avons montré que 187 régions du patrimoine génétique étaient différentes entre les patients muco à atteinte pulmonaire modérée et ceux à atteinte sévère. Dans ce projet, nous proposons d’identifier, parmi ces 187 régions, des marqueurs épigénétiques prédictifs de la sévérité de l’atteinte pulmonaire. L’étude précédente avait été réalisée sur de l’ADN extrait de cellules épithéliales nasales, nous proposons désormais d’analyser les marqueurs sur un modèle cellulaire non invasif : l’expectoration spontanée.

L'étude consiste à 4 expectorations spontanées (collection de crachat) à intervalles de six mois environ .