Infection

Principal : L'objectif principal de cette étude est d'évaluer la modification de la sensibilité de P.a aux antibiotiques nébulisés en étudiant l'évolution des CMI de P.a à la colistine, la tobramycine, la ciprofloxacine et les β-lactames.

Secondaires :
Les objectifs secondaires visent à rassembler toutes les informations pertinentes qui pourraient expliquer le modèle d'évolution de la CMI de P.a. Ils comprennent :
i.La caractérisation génétique des souches de P.a montrant une augmentation significative de la CMI à un ou plusieurs antibiotiques.
ii.L'évaluation de la sensibilité d'autres bactéries pertinentes pour la mucoviscidose (Achromobacter, Stenotrophomonas maltophilia, Burkholderia) aux antibiotiques inhalés.
iii.Évolution des paramètres cliniques : VEMS, IMC, nombre d'exacerbations, score symptomatique et type de colonisation bactérienne.
iv.Historique de la prise en charge thérapeutique : type d'antibiotiques utilisés, nombre de jours avec antibiotiques, dose et fréquence par jour.

Objectifs principaux :

- Tester la non infériorité d’une cure d’antibiotiques avec 5 jours de tobramycine (Nebcine®) en injection intra-veineuse suivi de 9 jours d’aérosols de tobramycine (Tobi®) par rapport à une cure d’antibiotiques classique (14 jours en injection intra-veineuse).

Objectifs secondaires :

- Evaluer l’efficacité clinique de la cure ressentie par le patient, l’intervalle entre deux exacerbations, la survenue de résistances bactériennes.

Evaluer l'impact de Kaftrio sur l'écologie microbienne chez les patients atteints de mucoviscidose.

- Etudier la composition de la flore bactérienne et fongique du microbiote à l'intérieur des échantillons de crachats recueillis au cours du traitement par Orkambi.
- Déterminer la corrélation entre les changements dans le mycobacterium pulmonaire et les communautés bactériennes, les modifications de la fonction pulmonaire et l'état clinique des patients atteints de mucoviscidose.

L'objectif principal de cet essai est d'évaluer les performances diagnostiques du taux d'interferon gamma libéré après stimulation par des pathogènes mycobactériens dans le diagnostic des MNT posé par une sérologie et/ou une culture positive chez des patients atteints de mucoviscidose faisant partie de la cohorte CIMeNT.

Détecter par culture des bactéries anaérobies dans les expectorations (actuellement non recherchées dans le cadre du suivi habituel)

Evaluer la concordance entre les prélèvements nasopharyngés et ceux issus de l'expectoration, en terme de détection virale chez des patients atteints de mucoviscidose